알파폴드 예측을 활용한 단백질-핵산 상호작용 인터페이스의 구조적 안정성 평가

본 주제는 AI 기반의 단백질 구조 예측 도구인 AlphaFold를 확장하여, 단백질과 핵산(DNA/RNA) 사이의 결합 인터페이스가 가지는 입체적 안정성을 계산적으로 분석하는 융합 연구 분야이다.

융합적 접근의 필요성

• 이는 전통적인 구조생물학 실험 방식의 한계를 극복하며, 대량의 생물정보학 데이터에 기반하여 특정 유전자 조절 메커니즘의 분자적 실체를 밝히고자 한다.
• 특히, 전사 인자가 DNA의 특정 서열에 어떻게 결합하여 유전자 발현 조절을 수행하는지에 대한 상세한 기전을 제공한다.

연구는 단순히 구조를 예측하는 것을 넘어, 외부 요인(예: 이온 환경, 대사체 신호) 변화 시 해당 인터페이스의 결합 친화도 및 열역학적 안정성 변화를 예측하는 방향으로 발전하고 있다. 이는 궁극적으로 정밀의료 및 신약 개발 타겟 발굴에 기여할 잠재력을 가진다.